『証明する書面』に出願人の押印または署名（サイン）が必要なくなったと聞きましたが、それを行うことは禁止されていますか？

いいえ、禁止されていません。従来通り、『証明する書面』に押印または署名（サイン）をしても問題ありません。出願人名（法人の場合は法人名または法人を代表する者の名義）で行ってください。押印または署名（サイン）がなくても、審査における不利益は生じません。